Les habitats d’intérêt communautaire inscrits en annexes I de la directive habitat et justifiant le classement du site sont les suivants :
| Libellé | Code Natura 2000 |
|---|---|
| Sources pétrifiantes avec formation de travertins (Cratoneurion) | 7220 |
| Forêts de pentes, éboulis ou ravins du Tilio-Acerion | 9180 * |
| Forêts alluviales à Alnus glutinosa et Fraxinus excelsior (Alno-Padion, Alnion incanae, Salicion albae) | 91E0 |
| Rivières des étages planitiaire à montagnard avec végétation du Ranunculion fluitantis et du Callitricho-Batrachion | 3260 |
| Lacs eutrophes naturels avec végétation du Magnopotamion ou de l'Hydrocharition | 3150 |
| Eaux oligo-mésotrophes calcaires avec végétation benthique à Chara spp | 3270 |
| Eaux oligotrophes très peu minéralisées des plaines sablonneuses (Littorelletalia uniflora) | 3110 |
| Tourbières basses alcalines | 7230 |
| Mégaphorbiaies hygrophiles d'ourlets planitiaires et des étages montagnard à alpin | 6430 |
| Prairies maigres de fauche de basse altitude (Alopecurus pratensis, Sanguisorba officinalis) | 6510 |
| Landes sèches européennes | 4030 |
| Rivières alpines avec végétation ripicole ligneuse à Salix eleagnos | 3240 |
